Простийпошук |
Розширенийпошук |
Покажчики
|
Професійний пошук |
Рубрикатор НБУВ |
Розподілений пошук |
Бази даних
Наукова періодика України - результати пошуку
Книжкові видання та компакт-дискиЖурнали та продовжувані виданняАвтореферати дисертаційРеферативна база данихНаукова періодика УкраїниТематичний навігаторАвторитетний файл імен осіб
 |
Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер "Mozilla Firefox" |
|
|
Повнотекстовий пошук
| Знайдено в інших БД: | Реферативна база даних (4) |
Список видань за алфавітом назв: Авторський покажчик Покажчик назв публікацій  |
Пошуковий запит: (<.>A=Гордейчик О$<.>) | |||
|
Загальна кількість знайдених документів : 3 Представлено документи з 1 до 3 |
|||
| 1. | 
Кириченко А. М. Вибірковість кодонів і заміни нуклеотидів у генах вірусу карликовості сої [Електронний ресурс] / А. М. Кириченко, О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2012. - Т. 74, № 3. - С. 90-97. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2012_74_3_15 Проведено комп'ютерний аналіз вибірковості кодонів і спонтанних замін нуклеотидів у шести штамів вірусу карликовості сої. Встановлено, що частота використання синонімічних кодонів у вірусних генах широко варіює залежно від гена, перекривання генів, кодона, послідовності перших двох кодонних нуклеотидів, однонуклеотидних контекстів, локалізованих перед кодоном і за ним, а також від вмісту GC (G+C) у генах і в третій позиції кодонів. Під впливом перекривання генів загальна кількість нуклеотидних замін зменшується в 2,5 разів, кількість еквівалентних замін у третій позиції кодонів - у 2,8 - 4,3 рази, вміст дикодонів у генах - у 1,4 - 1,6 разів. Поряд із цим спостерігається збільшення кількості нееквівалентних замін нуклеотидів у другій кодонній позиції, а також висока вибірковість кодонів (Fop = 0,94 - 1,0) і кореляція між вмістом нуклеотидів у генах і третіх позиціях кодонів (r = 0,73 - 0,74). Одержані результати свідчать про наявність селекції дикодонів у вірусних генах. | ||
| 2. |
Гордейчик О. І. Контексти стартових кодонів трансляції генів тобамо- і потексвірусів [Електронний ресурс] / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 1. - С. 39-46. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_1_8 Проведено комп'ютерний аналіз контекстів (нуклеотидного оточення) канонічного стартового кодона трансляції AUG у 15 тобамовірусів (45 генів) і 22 потексвірусів (110 генів). Встановлено, що контексти AUG вірусів рослин мають як високу схожість із відповідними контекстами еукаріотів, так і деякі особливості. Схожість проявляється в локалізації збіжних нуклеотидів поблизу стартового кодона (в позиціях -3... +18), наявності пурина в позиції -3 (-3R) і гуаніна в позиції +4 (+4G) відносно кодона AUG, а також у подібності трансляційних контекстів вірусів відповідним контекстам хребетних тварин (16,9 - 52,4 %) та однодольних (21,9 - 41,2 %) і дводольних рослин (39,3 - 74,3 %). Характерною особливістю вірусних трансляційних контекстів є висока частота компонентів +5С, -5Y і +10R, а також широке варіювання частоти контекстних елементів у різних вірусів і/або генів. Обговорено запропонований показник подібності трансляційних контекстів відомим консенсусним послідовностям. | ||
| 3. |
Гордейчик О. І. Контексти супресивних термінальних кодонів трансляції генів РНК‑вмісних вірусів рослин [Електронний ресурс] / О. І. Гордейчик, І. С. Щербатенко // Мікробіологічний журнал. - 2010. - Т. 72, № 6. - С. 58-65. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/MicroBiol_2010_72_6_11 Проведено комп'ютерний пошук в генетичних банках даних супресивних термінальних кодонів трансляції (СТКТ) генів вірусів рослин та порівняльний аналіз контекстів супресії цих кодонів. Встановлено, що в геномах вірусів рослин найчастіше супресуються стоп-кодони UAG (167 із 211, 79,1 %), рідше - UGA (37/211, 17,5 %) і зовсім рідко - UAA (7/211, 3,3 %). Більшість слабких (супресивних) термінальних кодонів у відносній позиції +4 містять гексануклеотидні сайти caauua, cgguuu, gggugc, ggaggc або guagac, які вважаються важливими (консенсусними) елементами контекстів СТКТ РНК-вмісних вірусів рослин, тварин і мікроорганізмів. Поряд із цим у генах багатьох вірусів спостерігається широка мінливість послідовностей консенсусних гексануклеотидних сайтів, а також додаткові позиції їх локалізації в різних рамках зчитування і на різних відстанях від термінальних кодонів. Характерною рисою супресивних термінальних кодонів трансляції є наявність кластерів збіжних нуклеотидних сайтів у різних родів вірусів на ділянках довжиною до кількох сотень нуклеотидів від цих кодонів. Результати проведених досліджень підтримують припущення про те, що ефективність трансляції, а також прочитування стоп-кодонів можуть бути детерміновані на рівні геномів чи генів, а не лише короткими контекстами, що оточують термінальні кодони. | ||
Попередній перегляд: 
Реферативна БД
 |
| Відділ наукової організації електронних інформаційних ресурсів |
 Пам`ятка користувача |